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CSD剑桥结构数据库

【访问网址】:http://webcsd.ccdc.cam.ac.uk

【试用期限】:即日起至2017.12.31

【试用内容】:CSD剑桥结构数据库

【开通范围】:天津科技大学校园网IP进行访问

【适用学科】:化学、材料等专业

 试用账号:407891475@qq.com  密码:123456

数据库介绍:

剑桥晶体数据中心(CCDC, Cambridge Crystallographic Data Centre)1965年起就从事晶体数据的收集、整理与计算机化工作。该中心发展的剑桥结构数据库CSD (Cambridge Structural Database)是基于X光和中子衍射实验唯一的小分子及金属有机分子晶体的结构数据库。

CSD基本上包括已发表的所有原子个数(包括氢原子)500以内的有机及金属有机化合物晶体数据,并对收集的数据进行严格评审。随着PDBNDB(Nucleic Acid Database)快速发展,CSD不再包括低核苷酸的数据,但增加了高分子的数据。

CSD通过CSDS(Cambridge Structural Database System)平台提供服务,CSDS包括功能完整的应用软件,不仅具有数十种查询化合物的方法,还提供了分子结构信息统计方法和三维图像演示方法,以帮助研究人员寻找、观察、分析和总结有关的化合物信息。CSDS软件分为基本软件系统和图形软件系统。

CSD(剑桥晶体结构数据)包括以下产品系列:

 

 1. CSD 3D Graphics Search System(包括PreQuest,ConQuest,Mercury: CSDS的核心,目前CSD收集了约47.5万分子结构,并以每年9%的速度进行增长。随着实验方法的进步,新装入数据的质量越来越高, 超过91%的数据拥有小于0.05R值。

PreQuest: 可方便用户构建自己专用的晶体结构数据库,然后可对该数据库用ConQuest 独立或与CSD相结合进行搜索。

ConQuest: 用于从剑桥结构数据库搜索和提取结构信息的基础软件。该软件提供在剑桥结构数据库中全方位的文字与数字查询,同时还具有更高级的搜索功能:化学亚结构的搜索;几何结构的搜索;分子间和分子内相互关系的搜索。对于所查询的每个三维化学亚结构,ConQuest 可帮助用户定义,提取和输出与之对应的一系列几何参数,并直接与Mercury相链接以显示选中的结构,或者与Vista 链接以分析和显示所提取的几何数据。

Mercury: 提供了一整套丰富的软件工具用于显示及比较晶体与分子结构,从而探索分子网络与晶胞堆积。

2. IsoStar: 对收集在CSDPDB实验数据库中的非键相互作用的几何参数信息进行快速访问。

3. Mogul: 可迅速地从CSD中几百万个各类化学键长,键角和非环扭转角 数据中提取信息以便快捷地显示分子的几何结构。应用范围包括验证新的晶体结构,发现新的几何特性,查证通过计算而得到的构象(如过滤筛选蛋白质-配体嵌合模拟的结果以便去除不可能的配体构象),及建立配体库以用于蛋白质晶体结构的精调。

4.Solid Form Module

5.DASH

6.Superstar

 

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